Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 TMPPE-202ENST00000416695 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL157400.2-201ENST00000454174 563 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC133552.3-201ENST00000572236 1869 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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