Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTPAP49638 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTPAP49638 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTPAP49638 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTPAP49638 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTPAP49638 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTPAP49638 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTPAP49638 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TTPAP49638 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TTPAP49638 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TTPAP49638 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TTPAP49638 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TTPAP49638 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TTPAP49638 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TTPAP49638 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms