Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TMPOP42166 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TMPOP42166 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TMPOP42166 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TMPOP42166 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TMPOP42166 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TMPOP42166 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TMPOP42166 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TMPOP42166 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TMPOP42166 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TMPOP42166 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TMPOP42166 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TMPOP42166 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TMPOP42166 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TMPOP42166 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TMPOP42166 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TMPOP42166 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TMPOP42166 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TMPOP42166 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TMPOP42166 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TMPOP42166 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TMPOP42166 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TMPOP42166 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TMPOP42166 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TMPOP42166 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TMPOP42166 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TMPOP42166 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TMPOP42166 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TMPOP42166 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms