Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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PTPRAP18433 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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PTPRAP18433 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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