Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 MIR3187-201ENST00000583431 70 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VPREB1P12018 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms