Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L3

Oc90, Otoconin-90, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oc90Q9Z0L3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Oc90Q9Z0L3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Oc90Q9Z0L3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms