Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms