Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP36Q9P275 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP36Q9P275 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP36Q9P275 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP36Q9P275 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP36Q9P275 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP36Q9P275 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP36Q9P275 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP36Q9P275 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP36Q9P275 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP36Q9P275 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
USP36Q9P275 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
USP36Q9P275 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms