Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pard6bQ9JK83 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms