Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms