Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms