Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx7Q9CY18 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms