Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms