Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubash3bQ8BGG7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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