Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CltbQ6IRU5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CltbQ6IRU5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms