Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms