Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms