Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIN2AQ12879 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms