Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NrepQ07475 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NrepQ07475 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NrepQ07475 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms