Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms