Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms