Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms