Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms