Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P06323 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P06323 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P06323 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P06323 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P06323 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P06323 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P06323 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P06323 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P06323 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P06323 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P06323 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P06323 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P06323 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P06323 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06323 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P06323 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P06323 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P06323 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P06323 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P06323 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P06323 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P06323 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
P06323 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P06323 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06323 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06323 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06323 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06323 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06323 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06323 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06323 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06323 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06323 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06323 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06323 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06323 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06323 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06323 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06323 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06323 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06323 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06323 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06323 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06323 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06323 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06323 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06323 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06323 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms