Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPHP4O75161 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms