Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17555F6U8B9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms