Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
1700042G07RikB1AUF7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms