Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms