Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms