Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
USP35Q9P2H5 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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