Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 GTF2F2P2-201ENST00000445825 721 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL133215.1-201ENST00000447344 342 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC006120.1-201ENST00000579375 546 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC017104.2-201ENST00000417000 321 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 LINC00460-203ENST00000444865 739 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC092720.1-203ENST00000563921 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC027688.2-201ENST00000569009 511 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL786P-201ENST00000579130 298 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms