Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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BRD3Q15059 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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BRD3Q15059 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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