Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms