Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms