Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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CDH18Q13634 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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CDH18Q13634 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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