Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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