Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN7O94888 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms