Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms