Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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TDP1Q9NUW8 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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TDP1Q9NUW8 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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TDP1Q9NUW8 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TDP1Q9NUW8 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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