Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms