Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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TDRD12Q587J7 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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