Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms