Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms