Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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