| RUNX3 | Q13761 | AL591438.1-201 | ENST00000433508 | 581 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL136455.1-201 | ENST00000441083 | 1240 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC096741.1-201 | ENST00000472250 | 846 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL5P22-201 | ENST00000480199 | 884 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC117383.1-201 | ENST00000507698 | 422 nt | TSL 3 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC096759.1-201 | ENST00000510744 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HHIP-AS1-203 | ENST00000512359 | 646 nt | TSL 3 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018680.1-201 | ENST00000513332 | 875 nt | TSL 3 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6ATAC39P-201 | ENST00000516309 | 149 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IGKV1-32-201 | ENST00000519290 | 311 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ANP32E-205 | ENST00000533654 | 908 nt | TSL 2 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAV11-201 | ENST00000539512 | 339 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL132712.2-201 | ENST00000556653 | 127 nt | TSL 3 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGN2P47-201 | ENST00000559378 | 272 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092134.1-201 | ENST00000563690 | 800 nt | TSL 3 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009117.3-202 | ENST00000563825 | 557 nt | TSL 4 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC023389.2-201 | ENST00000580031 | 955 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF1P5-201 | ENST00000585002 | 234 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR6133-201 | ENST00000617057 | 108 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR6839-201 | ENST00000620425 | 113 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR7703-201 | ENST00000620784 | 77 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SMARCA2-231 | ENST00000634931 | 939 nt | TSL 5 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005972.4-201 | ENST00000636248 | 1131 nt | TSL 5 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRPM6-203 | ENST00000361255 | 8271 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099654.2-201 | ENST00000433031 | 1980 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL137058.3-201 | ENST00000624531 | 3099 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL355488.2-201 | ENST00000609909 | 2850 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MECOM-209 | ENST00000472280 | 3593 nt | TSL 5 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PWRN2-202 | ENST00000567246 | 4295 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SAMMSON-226 | ENST00000642089 | 1582 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PRR14L-201 | ENST00000327423 | 10826 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RYR3-212 | ENST00000634891 | 15591 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SMCO1-201 | ENST00000397537 | 1812 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C3orf58-202 | ENST00000441925 | 3260 nt | TSL 2 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RMST-209 | ENST00000639542 | 3269 nt | TSL 5 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02397-201 | ENST00000504409 | 10626 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC015813.1-203 | ENST00000585065 | 4722 nt | TSL 2 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MFSD8-216 | ENST00000641147 | 4009 nt | BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MCMDC2-204 | ENST00000422365 | 5096 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYP3A7-CYP3A51P-202 | ENST00000620220 | 1704 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PSD3-201 | ENST00000286485 | 6665 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CEP164P1-202 | ENST00000456938 | 2472 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DNA2-201 | ENST00000358410 | 4208 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL160286.3-201 | ENST00000569644 | 3294 nt | TSL 2 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF571-203 | ENST00000451802 | 2265 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BDNF-AS-202 | ENST00000499568 | 2039 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SAMSN1-206 | ENST00000619120 | 2028 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CPA3-201 | ENST00000296046 | 1795 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP191-201 | ENST00000362585 | 102 nt | BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP505-201 | ENST00000364748 | 108 nt | BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR51I1-201 | ENST00000380211 | 945 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA77-201 | ENST00000408716 | 125 nt | BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR2A25-201 | ENST00000408898 | 1014 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00364-201 | ENST00000415120 | 611 nt | TSL 3 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL133268.3-201 | ENST00000428903 | 577 nt | TSL 5 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL19P16-201 | ENST00000433839 | 588 nt | BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GUSBP6-201 | ENST00000434932 | 640 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL161618.1-201 | ENST00000438738 | 761 nt | TSL 5 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND4LP12-201 | ENST00000448237 | 295 nt | BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006967.1-201 | ENST00000467608 | 589 nt | BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C10orf128-207 | ENST00000474718 | 614 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP72-201 | ENST00000492447 | 435 nt | BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TM4SF1-AS1-202 | ENST00000496491 | 754 nt | TSL 2 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC096773.1-201 | ENST00000506852 | 648 nt | TSL 3 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC115622.1-201 | ENST00000509628 | 587 nt | TSL 3 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010245.1-201 | ENST00000511329 | 754 nt | TSL 3 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC026434.1-201 | ENST00000511474 | 454 nt | TSL 3 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MORF4L1P3-201 | ENST00000525966 | 950 nt | BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TAS2R46-201 | ENST00000533467 | 930 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000619.2-201 | ENST00000546014 | 969 nt | BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090519.2-201 | ENST00000559034 | 655 nt | TSL 5 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018552.1-201 | ENST00000562099 | 811 nt | BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004160.1-210 | ENST00000599875 | 689 nt | TSL 5 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL512782.1-201 | ENST00000603093 | 364 nt | BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005377.1-201 | ENST00000605126 | 456 nt | BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018628.1-201 | ENST00000624147 | 3819 nt | BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR8A1-203 | ENST00000641670 | 5709 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR4F5-202 | ENST00000641515 | 2618 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC139713.2-209 | ENST00000509873 | 1303 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CPSF2-201 | ENST00000298875 | 13035 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RIMS2-209 | ENST00000507740 | 8002 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC083837.1-201 | ENST00000565297 | 2994 nt | BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KIAA0408-204 | ENST00000483725 | 3284 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 5.15 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | STIL-204 | ENST00000396221 | 4558 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF143-201 | ENST00000299606 | 2562 nt | TSL 5 BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF214-204 | ENST00000536068 | 2562 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLEKHS1-204 | ENST00000369310 | 2046 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAPK6PS2-201 | ENST00000379571 | 2060 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NTRK3-205 | ENST00000394480 | 19984 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FILIP1-201 | ENST00000237172 | 4580 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KMT5B-215 | ENST00000615954 | 4306 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC016705.1-201 | ENST00000548231 | 1891 nt | TSL 5 BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PHC3-214 | ENST00000494943 | 5030 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADIG-201 | ENST00000373348 | 430 nt | TSL 2 BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-167P-201 | ENST00000384292 | 106 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL136116.2-201 | ENST00000404020 | 785 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL390316.1-201 | ENST00000406279 | 553 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS20P25-201 | ENST00000412447 | 352 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092570.3-201 | ENST00000420113 | 693 nt | BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL136979.1-201 | ENST00000421645 | 1120 nt | TSL 3 BASIC | 5.14 | □□□□□ -1.59 | | |