Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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RUNX3Q13761 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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