Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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PTCH1Q13635 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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PTCH1Q13635 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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PTCH1Q13635 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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PTCH1Q13635 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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PTCH1Q13635 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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PTCH1Q13635 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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PTCH1Q13635 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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PTCH1Q13635 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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