Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PICALMQ13492 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms