Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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IFT88Q13099 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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IFT88Q13099 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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IFT88Q13099 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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