Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RASGEF1BQ0VAM2 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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