Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFFO1Q0D2I5 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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